Alternant(e) en bioinformatique (H/F)

Description de l'offre

Description du poste

Dans le cadre de nos activités de recherche de biomarqueurs et d’étude de mécanismes de sensibilité/résistance de composés pharmacologiques, nous souhaitons évaluer l’activation de voies de signalisation et de facteurs de transcription par échantillon à partir de profils d’expression génique issus principalement de données RNA-seq.

Dans ce contexte, nous recherchons un(e) alternant(e) pour participer aux projets du département de bioinformatique et de biologie computationnelle.

Missions

·  Recensement et description des méthodologies d’intérêt,
·  Implémentation d’une sélection de méthodologies sur la plateforme d’analyse interne (HPC et/ou R),
·  Evaluation des méthodologies sélectionnées sur des jeux de données contrôlés,
·  Comparaison des outils évalués (avantages/inconvénients),
·  Rédaction des bonnes pratiques d’utilisation et d’interprétation pour les outils pertinents.

Profil recherché

• Master en bioinformatique

• Bonnes connaissances des environnements UNIX et R

• Bases de biologie moléculaire et statistique