CDD Nestlé R&D Thèse Tours (37) H/F

Description de l'offre

Pour Nestlé, la R&D représente un avantage compétitif clé. Sans ses services de R&D, Nestlé n'aurait pas pu devenir le leader du secteur alimentaire en matière de nutrition, de santé et de bien-être.
Avec 29 installations consacrées à la recherche, au développement et à la technologie dans le monde, Nestlé est à la tête du plus grand réseau de recherche et développement agroalimentaire.
Ce réseau, associé à des groupes d'application aux marchés locaux, emploie plus de 5 000 personnes.
Le Centre R&D de Tours est le spécialiste des sciences végétales.

Offre de Thése – CDD 2017-2020

Sujet : Développement d'outils génomiques et génétiques pour l'amélioration génétique du rendement et de la tolérance aux maladies fongiques du cacaoyer ( Théobroma cacao ).

I Contexte
Le sujet de thèse est proposé au sein du centre de recherche et développement Nestlé basé à Tours. Notre établissement est référencé comme laboratoire d'accueil de l'université de Rennes depuis de nombreuses années. Notre centre travaille exclusivement dans le domaine du végétal principalement sur des espèces pérennes d'origines tropicales comme le caféier et le cacaoyer qui sont des ressources génétiques d'importance pour le groupe Nestlé. Nous avons développé un vaste réseau d'essai en champs en particulier en Equateur où se trouve notre principale ferme d'essais en champs et nous disposons aussi d'accès privilégiés au sein d'universités américaines comme Cornell (NY) et aux plateformes de génomiques internes à notre groupe en Suisse.

II Thématique du stage de thèse
Notre laboratoire est impliqué dans les études de rendement et sur la qualité des productions de café et de cacao afin d'aider au maintien de ces cultures dans les pays producteurs. Le sujet pour lequel nous cherchons un collaborateur est axé sur le développement d'outils génétiques et de génomiques pour l'obtention de variétés de cacaoyers avec des rendements importants et résistants aux maladies fongiques comme la moniliose ou le balai de sorcière.

Pour réaliser ce projet nous avons développé un partenariat avec le CATIE basé au Costa Rica qui a généré un plan factoriel partiel à partir de six parents sélectionnés pour différents critères comme la résistance aux maladies, la valeur gustative, la productivité. Huit populations ségrégeantes a été ainsi obtenues avec 130 à 200 individus pour chacune de ces familles qui ont été plantées dans deux sites dont un en Equateur et l'autre au Costa Rica. Les premières données agronomiques concernant le rendement sont déjà disponibles pour ces descendances.
L'étudiant(e) aura la charge de développer, en partenariat avec notre personnel scientifique, les analyses génétiques et génomiques en relation avec ce projet. Ainsi les analyses de diversité génétique des collections de Nestlé et d'autres instituts comme le CATIE ou l'université de Reading (UK) ont été réalisées et mettent en évidence une dizaine de groupes génétiques chez le cacaoyer. Une étude plus restreinte de séquençage sur des clones représentatifs de ces groupes génétiques est actuellement en cours afin de créer une puce ADN qui devrait permettre de réaliser le génotypage des individus de notre étude. De plus, bien que deux séquençages du génome de cacaoyer soient disponibles nous allons aussi séquencer en technologie Pacbio un représentant d'un des groupes génétiques du cacaoyer. En parallèle au développement de ces outils ce collaborateur travaillera en étroite collaboration avec notre sélectionneur pour la mise en place des meilleures stratégies d'amélioration des plantes pour mener à bien le développement des nouvelles variétés de cacaoyers.


III Conditions du recrutement
L'étudiant(e) devra être inscrit à une école doctorale en France en relation avec l'amélioration des plantes. Il sera recruté pour une durée de 3 ans (Octobre 2017-Septembre 2020) en CDD par notre centre R&D.