Stage - Ingénieur/Master - Biologie, biophysique et biochimie
Stage Grenoble (Isère) Conception / Génie civil / Génie industriel
Description de l'offre
Détail de l'offre
Informations générales
Entité de rattachement
Le Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) est un organisme public de recherche.Acteur majeur de la recherche, du développement et de l'innovation, le CEA intervient dans le cadre de ses quatre missions :
. la défense et la sécurité
. l'énergie nucléaire (fission et fusion)
. la recherche technologique pour l'industrie
. la recherche fondamentale (sciences de la matière et sciences de la vie).
Avec ses 16000 salariés -techniciens, ingénieurs, chercheurs, et personnel en soutien à la recherche- le CEA participe à de nombreux projets de collaboration aux côtés de ses partenaires académiques et industriels.
Référence
2018-4983-88443Délai de traitement
3 mois
Description du poste
Domaine
Biologie, biophysique et biochimie
Contrat
Stage
Intitulé de l'offre
Stage - Ingénieur/Master - Biologie, biophysique et biochimie
Sujet de stage
Stage de master en bioinformatique : Rôles des microARN des exosomes de cellules cancéreuses
Durée du contrat (en mois)
4-6 mois
Description de l'offre
Les microARN sont de petits ARN d'une vingtaine de nucléotides. Ils sont des régulateurs majeurs de l'expression des gènes codants pour les protéines. Ils peuvent donc agir sur les voies de signalisations de protéines (en les réprimant ou en les exacerbant). Les exosomes sont des microvésicules sécrétées par les cellules et qui servent notamment à la communication inter-cellulaires. Les exosomes contiennent des microARN, de l'ADN, des protéines qui peuvent être déversés dans les cellules cibles. L'importance à la fois des microARN et des exosomes dans le cancer a été maintes fois démontrée. L'objectif du projet est d'inférer (i.e. de prédire) quelles voies de signalisation sont affectées par les microARN des exosomes dans les cellules cibles. Pour cela, les données de séquençage des microARN (miR-seq) des cellules sécrétrices des exosomes et des exosomes eux-mêmes seront utilisées. Des réseaux de microARN [1] serviront à l'interprétation des résultats. En fonction de l'avancée du stage, les données de protéomique seront aussi prises en compte pour affiner les prédictions. Le cancer de la glande corticosurrénale est un cancer rare (1 à 2 cas par million d'habitants), étudié historiquement dans l'équipe d'accueil [2]. Les données utilisées proviendront de lignées cellulaires de ce cancer. Références : 1. Bhajun R, Guyon L, Pitaval A, Sulpice E, Combe S, Obeid P, et al. A statistically inferred microRNA network identifies breast cancer target miR-940 as an actin cytoskeleton regulator. Sci Rep. 2015;5:8336. 2. Cherradi N. microRNAs as Potential Biomarkers in Adrenocortical Cancer: Progress and Challenges. Front Endocrinol (Lausanne). 2016;6:195.
Profil recherché
Profil du candidat
Ingénieur/Master
Fouille de données et données déjà disponibles à analyser.--R -Cytoscape
Bac + 4/5