Stage en IRM H/F
Stage Saclay (Essonne) Développement informatique
Description de l'offre
Détail de l'offre
Informations générales
Entité de rattachement
Le Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) est un organisme public de recherche.Acteur majeur de la recherche, du développement et de l'innovation, le CEA intervient dans le cadre de ses quatre missions :
. la défense et la sécurité
. l'énergie nucléaire (fission et fusion)
. la recherche technologique pour l'industrie
. la recherche fondamentale (sciences de la matière et sciences de la vie).
Avec ses 16000 salariés -techniciens, ingénieurs, chercheurs, et personnel en soutien à la recherche- le CEA participe à de nombreux projets de collaboration aux côtés de ses partenaires académiques et industriels.
Référence
2019-8102Description de l'unité
NeuroSpin (Institut Frédéric Joliot, Direction de la recherche Fondamentale du CEA), est un centre de recherche en imagerie cérébrale par résonance magnétique IRM à très haut champ dirigé par le Professeur S. Dehaene, et situé à Saclay (Essonne).
NeuroSpin a pour objectif de comprendre l'organisation et le fonctionnement du cerveau humain, son développement, et ses dysfonctionnements, par une approche multi-échelle et multi-modalité (IRM, études comportementales et neurophysiologie par EEG et MEG).
Délai de traitement
2 mois
Description du poste
Domaine
Electromagnétisme, génie électrique
Contrat
Stage
Intitulé de l'offre
Stage en IRM H/F
Sujet de stage
Développement d'outils de reconstruction d'image en IRM
dans l'environnement open source Gadgetron
Durée du contrat (en mois)
6
Description de l'offre
L’imagerie par résonance magnétique (IRM) est une technique de pointe pour caractériser le tissu cérébral sain et pathologique. Cependant, les possibilités offertes par l’IRM sont limitées par la durée des examens et la sensibilité au mouvement. De nouvelles méthodes développées in situ permettent d’accélérer l’acquisition, d’améliorer la résolution des images et d’obtenir des informations quantitatives plus pertinentes et spécifiques aux tissus pathologiques. En parallèle, les méthodes de reconstructions associées nécessitent l’utilisation d’algorithmes complexes et performants. Pour intégrer ces technologies émergentes dans les études de cohortes sur le vieillissement cérébral et les maladies neurodégénératives actuelles, enjeu majeur de notre société, il est indispensable de développer des outils robustes, opérationnels et de les rendre accessibles à tous les utilisateurs.
Récemment, un logiciel open source, appelé Gadgetron, a été proposé pour externaliser la reconstruction des images tout en garantissant leur disponibilité à la console IRM en post-reconstruction. Cet environnement permet de développer rapidement des prototypes en s’appuyant sur la richesse des langages courants : Python, Matlab et C++ et leurs bibliothèques respectives.
Suite à l’installation récente de l’environnement Gadgetron sur les IRM 3T et 7T de NeuroSpin, le candidat aura pour mission d’y intégrer les algorithmes de reconstruction récemment développés dans le laboratoire afin de les rendre fonctionnels, fiables et accessibles sur les consoles d’acquisition IRM. De plus, de nouvelles méthodes de reconstruction pourront être développées et évaluées pour répondre aux besoins des diverses techniques d’acquisition en place au laboratoire.
En cas de succès, ces outils seront utilisés dans les différents protocoles de recherche ouvrant ainsi de nouvelles voies d’études cliniques et neuroscientifiques pour le futur.
Profil recherché
Profil du candidat
Le(a) candidat(e) est un(e) étudiant(e) en deuxième année de Master avec une spécialisation dans le traitement d'image ou la programmation informatique, ou ayant un parcours dans les sciences de l'ingénieur, avec un goût prononcé pour la programmation.
La connaissance d'au moins un langage parmi C++, Python et MatLab est indispensable.
Une grande capacité du travail en équipe sera aussi requise, agrémentée d'une bonne connaissance de l'anglais.