Ingénieurs informatique Environnement HPC / devops/ administration Linux (2 postes) – H/F
CDI Évry (Essonne) Développement informatique
Description de l'offre
Détail de l'offre
Informations générales
Entité de rattachement
Le Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) est un organisme public de recherche.Acteur majeur de la recherche, du développement et de l'innovation, le CEA intervient dans le cadre de ses quatre missions :
. la défense et la sécurité
. l'énergie nucléaire (fission et fusion)
. la recherche technologique pour l'industrie
. la recherche fondamentale (sciences de la matière et sciences de la vie).
Avec ses 16000 salariés -techniciens, ingénieurs, chercheurs, et personnel en soutien à la recherche- le CEA participe à de nombreux projets de collaboration aux côtés de ses partenaires académiques et industriels.
Référence
2017-2005Description de la Direction
Le Centre National de recherche en génomique humaine (CNRGH) du Commissariat à l'Energie Atomique (CEA), localisé au sein de la Genopole d'Evry, a comme objectif principal de faire avancer la recherche en génétique des maladies humaines.
Description de l'unité
Le CNRGH a développé des laboratoires et des plateformes technologiques de pointe en génomique. Les technologies disponibles au CNRGH vont de plateformes de génotypage à haut débit complètement intégrées à des plateformes de séquençage nouvelle-génération. Les activités incluent des études d'association génome entier, d'expression pan-génomiques, épigénétiques, de génomique fonctionnelle et de séquençage génome entier.
Description du poste
Domaine
Mathématiques, information scientifique, logiciel
Contrat
CDI
Intitulé de l'offre
Ingénieurs informatique Environnement HPC / devops/ administration Linux (2 postes) – H/F
Statut du poste
Cadre
Description de l'offre
Ces recrutements visent à consolider une équipe de référence de niveau mondial dans le domaine de l'analyse de séquences à « haut débit », en renforçant sa capacité informatique d'analyse des données, le positionnant donc à l'interface entre l'informatique système et la bio-informatique.
Les missions envisagées sont les suivantes :
- Participation au déploiement des applications métiers utilisées par le centre (adaptation, compilation et installation, docker, puppet, easybuild, packaging d'applications)
- Développement d'utilitaires associés à l'environnement de calcul (en bash, python, perl, ...)
- Aide et conseil aux équipes de bioinformatique (standardisation et qualité de code, design patterns, optimisation pour le HPC, tests unitaires, intégration continue)
- Rédaction de documentation et de supports de formation.
Les candidats retenus seront intégrés au laboratoire de bioinformatique du CNRGH.
Profil recherché
Profil du candidat
Titulaire d'une formation en ingénierie des systèmes d'information - diplôme d'ingénieur ou Master 2 au minimum-, vous justifiez d'une excellente maîtrise des environnements Unix (installation et administration de serveurs, rédaction de scripts) ainsi que d'une maîtrise d'au moins 2 langages parmi les suivants : C, C++, python, java.
Une première expérience dans les domaines et technologies suivantes est très recommandée :
- HPC (Slurm, OpenMP, MPI...)
- Packaging (Easybuild, Conda)
- Conteneur machine (Docker, OpenStack...)
- Orchestrateurs (Puppet, Ansible...).
Un bon niveau en anglais est également requis dans le cadre de la lecture de documentation et de nos échanges à l'international.
Les postes demandent des capacités à communiquer au sein d'équipes pluridisciplinaires, à comprendre les problématiques scientifiques, de la rigueur et de l'autonomie.