Ingénieur Qualité Bioinformatique
CDI Fontenay-aux-Roses (Hauts-de-Seine) Développement informatique
Description de l'offre
Détail de l'offre
Informations générales
Entité de rattachement
Le Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) est un organisme public de recherche.Acteur majeur de la recherche, du développement et de l'innovation, le CEA intervient dans le cadre de ses quatre missions :
. la défense et la sécurité
. l'énergie nucléaire (fission et fusion)
. la recherche technologique pour l'industrie
. la recherche fondamentale (sciences de la matière et sciences de la vie).
Avec ses 16000 salariés -techniciens, ingénieurs, chercheurs, et personnel en soutien à la recherche- le CEA participe à de nombreux projets de collaboration aux côtés de ses partenaires académiques et industriels.
Référence
2019-8248Description de l'unité
Le Plan France Médecine Génomique 2025 (PFMG 2025) est un plan national piloté et soutenu par l'État. Il vise à positionner la France dans le peloton de tête des grands pays engagés dans la médecine génomique. Il est mis en œuvre par l'Alliance nationale pour les sciences de la vie et de la santé (Aviesan) qui regroupe les principaux acteurs de la recherche publique en biologie et santé (CEA, CHRU, CNRS, CPU, INRA, Inria, Inserm, Institut Pasteur, IRD).
Le PFMG 2025 vise à déployer les instruments du parcours de soins génomique. Il s'articule autour de trois grands objets :
• un réseau de douze plateformes de séquençage à visée sanitaire couvrant l'ensemble du territoire français. Les deux premières plateformes de séquençage, SeqOIA (Ile de France) et AURAGEN (Auvergne Rhône-Alpes) sont entrées en fonction en décembre 2018 et atteindront leurs objectifs cibles fin 2019. Les plateformes de séquençage suivantes seront choisies à partir de 2020.
• un Collecteur analyseur de données (CAD) mettant en place les outils pour exploiter les volumes de données générées.
• un Centre de référence, d'innovation, d'expertise et de transfert (CRefIX) permettant d'assurer les développements technologiques indispensables à la mise en œuvre du parcours.
Le CRefIX est une Unité Mixte de Service (UMS) entre l'Inserm, le CEA et l'Inria. Il est piloté par le directeur du Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH), Jean-François Deleuze, pour le CEA et Alain Viari pour l'Inria.
Description du poste
Domaine
Recherche biomédicale, clinique, préclinique
Contrat
CDD
Intitulé de l'offre
Ingénieur Qualité Bioinformatique
Statut du poste
Cadre
Durée du contrat (en mois)
12 à 36
Description de l'offre
Le CRefIX vous propose de mettre en œuvre et d'organiser les procédures de suivi et de contrôle qualité des SOP émise par le centre de référence du CRefIX sur les procédures informatiques et bioinformatiques à déployer sur les plateformes de séquençage et sur le CAD. Vous évoluerez au sein d'équipes bioinformatiques et les accompagnerez dans l’organisation du transfert de connaissances vers les plateformes de séquençage du PFMG2025.
De manière plus spécifique, vous serez en charge de :
- la mise en œuvre, le contrôle et le suivi des indications de conformité ;
- la rédaction de procédures d’exploitation normalisées (SOP) ;
- l’évaluation des solutions existantes ;
- la veille technologique dans le domaine du traitement de données issues de la génomique et transcriptomique ;
- l'échange de connaissances avec les bioinformaticiens des plateformes et du CAD;
- la présentation des travaux auprès des comités d’évaluation et des plateformes de séquençage du PFMG 2025.
Le poste est situé à Evry (91), 2 rue Gaston Crémieux, au Centre National de Recherche en Génomique Humaine.
Profil recherché
Profil du candidat
Diplôme de niveau bac +5 en informatique/bioinformatique, vous justifierez d'une expérience dans le domaine du contrôle qualité.
Aptitudes :
- rigueur et méthodologie ;
- attrait pour le travail rédactionnel ;
- aptitude à comprendre des problématiques scientifiques ;
- capacités à communiquer au sein d'équipes pluridisciplinaires ;
Connaissances techniques :
- bonne connaissance du domaine du génie logiciel et de la bioinformatique ;
- maîtrise des méthodes et normes de développement ;
- bon niveau d'anglais.