Développement et mise en œuvre d'un biocapteur plasmonique innovant sur fibres optiques H/F
Stage Grenoble (Isère) Développement informatique
Description de l'offre
Détail de l'offre
Informations générales
Entité de rattachement
Le Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) est un organisme public de recherche.Acteur majeur de la recherche, du développement et de l'innovation, le CEA intervient dans le cadre de ses quatre missions :
. la défense et la sécurité
. l'énergie nucléaire (fission et fusion)
. la recherche technologique pour l'industrie
. la recherche fondamentale (sciences de la matière et sciences de la vie).
Avec ses 16000 salariés -techniciens, ingénieurs, chercheurs, et personnel en soutien à la recherche- le CEA participe à de nombreux projets de collaboration aux côtés de ses partenaires académiques et industriels.
Référence
2018-7287Description de l'unité
L'équipe CREAB développe des activités de recherche à l'interface entre physique-chimie-biologie avec deux thématiques propres : 1/ la conception, le développement et l'utilisation de biocapteurs et/ou biopuces pour l'analyse d'interactions de l'échelle moléculaire jusqu'à des objets biologiques plus complexes comme les bactéries ou les cellules en vue d'applications dans le domaine des technologies pour la santé, 2/ la conception, le développement et l'utilisation de structures bio-inspirées et bio-hybrides à base des biopolymère, particulièrement l'ADN et ses analogues, les origamis ADN, comme briques de base ou mortier pour la préparation d'architectures auto-assemblées en vue d'applications au-delà du champs des technologies pour la santé (masques pour la nano-lithographie, assemblage de nanomatériaux fonctionnels, positionnement déterministe de nano-objets, nano-fils photoniques,…).
Délai de traitement
2 mois
Description du poste
Domaine
Biologie, biophysique et biochimie
Contrat
Stage
Intitulé de l'offre
Développement et mise en œuvre d'un biocapteur plasmonique innovant sur fibres optiques H/F
Sujet de stage
Développement et mise en œuvre d'un biocapteur plasmonique innovant sur fibres optiques : application à la détection de bactéries.
Durée du contrat (en mois)
6 mois
Description de l'offre
Contexte sociétal :
Comme en témoignent les actualités récentes, l’industrie agroalimentaire a besoin de dispositifs performants assurant un contrôle régulier et fiable de la présence de bactéries pathogènes dans ses produits et ses installations. S’il existe de nombreux moyens dédiés à l’analyse d’échantillons alimentaires, peu d’outils permettant le contrôle continu des installations « in situ » ont été développés.
Contexte scientifique et objectifs :
Dans ce contexte, l’objectif du stage proposé est de développer un biocapteur capable de détecter des bactéries à distance, sans marquage et en temps réel. Notre approche repose sur l’utilisation d’un réseau de fibres optiques (assemblage multifibre) microstructurées et dorées sur une extrémité. Chacune des fibres optiques de l’assemblage joue le rôle d’un capteur SPR (Résonance des Plasmons de Surface) individuel et la mesure de l’intensité de la lumière rétro-réfléchie en extrémité de fibre renseigne sur les variations d’indice optique au niveau de la surface d’or. Des études préalables réalisées au laboratoire ont permis de déterminer les conditions d’excitation des plasmons conférant une sensibilité optimale à ces capteurs : géométrie de la gravure, longueur d’onde d’excitation, épaisseur d’or... Une résolution d’environ 10-4 unité d’indice optique a été obtenue. Cette résolution est suffisante pour envisager la détection de bactéries.
Missions confiées :
Le stagiaire sera amené à participer aux étapes d’élaboration des biocapteurs et à leurs contrôles (métallisation, caractérisation MEB), puis à la fonctionnalisation et à la caractérisation des capteurs eux-mêmes (fonctionnalisation par dépôts ou optique, détermination des sensibilités, analyse des données recueillies par traitement d’image…). Enfin il participera à la mise en œuvre des biocapteurs pour l’application à la détection de bactéries et/ou d’objets modèles. Des tests préliminaires de détection seront menés dans un premier temps sur prisme (SPRi standard) afin de valider les sondes (anticorps, aptamères) et les cibles (bactéries ou objets modèles) utilisées.
Moyens / Méthodes / Logiciels
Moyens mis en œuvre (expériences, méthodes d'analyses, autres...) : bancs optiques de SPRi sur prism
Profil recherché
Profil du candidat
Les compétences de l'équipe d'accueil dans le domaine des biopuces et de l'imagerie par résonance plasmonique de surface et ses activités récentes sur la détection de bactéries pathogènes offrent une plateforme idéale pour développer cet outil de détection bactérienne sur fibres optiques.
Les axes de recherches développés durant ce stage se situent à l'interface optique/biologie. Des compétences en optique instrumentale et théorique ainsi qu'en analyse d'images (image J) seront nécessaires au bon déroulement du projet. Un intérêt pour la biologie et/ou des compétences en biologie moléculaire et/ou biochimie seront appréciées.