STAGE – Ingénieur(e) Recherche – Inférence de réseau d'interactions depuis des données omiques
Stage Vélizy-Villacoublay (Yvelines) Conception / Génie civil / Génie industriel
Description de l'offre
Contexte & Présentation d'équipe
Vous intègrerez le département « Therapeutic Sciences » de l'unité Biosphere Research. Ce département met au point des méthodes mathématiques et des algorithmes pour la modélisation, la simulation et l'analyse de modèles dynamiques de systèmes biologiques pour répondre à des problématiques d'identification de stratégies thérapeutiques, les mondes virtuels et la réalité augmentée, afin de permettre des expériences virtuelles proches du réel.
Rôle & Objectif
L'objectif du stage est d'implémenter une méthode permettant de construire automatiquement des réseaux d'interaction protéines-protéines ou des réseaux de régulation géniques. Cette construction se fera sur la base de données omiques c'est-à-dire protéomiques, génomiques et transcriptomiques. La méthode elle-même s'appuiera sur des algorithmes d'apprentissage statistique (Machine learning) et devra permettre d'intégrer les différents types de données précédemment cités.
Etudiant(e) en Ecole d'Ingénieurs ou Master universitaire, vous préparez un diplôme de niveau Bac+5.
Vous vous spécialisez en Mathématiques appliquées, Machine learning.
Stage obligatoire de validation de cursus, sous convention de stage.
Durée 6 mois maximum, à débuter dès Mars 2018
Compétences techniques requises
• Mathématiques appliquées
• Machine Learning
• Python (à défaut, scilab ou R)
• Bases en théorie des graphes
• Connaissances biologiques de base : cellule, gènes, protéines
Qualités professionnelles requises
• Autonomie
• Curiosité
• Savoir communiquer clairement sur son travail