Bioinformaticien confirmé (H/F)

Description de l'offre

Description du poste

Famille de métier

RECHERCHE ET INNOVATION - TRAIT ET SUPPORT SCIENTIFIQUE

Type de contrat

CDI

Temps de travail

Temps complet

Finalité du poste

Vous souhaitez contribuer à l'amélioration de l'efficacité de nos activités de découvertes de traits, rejoignez-nous !
Au sein de la recherche Grandes Cultures, dans le cadre de la mise en place d'une nouvelle organisation traits et technologies en support à la sélection, et dans un contexte d'évolution de nos efforts de recherche, nous recherchons un bioinformaticien expérimenté pour rejoindre la plateforme de recherche biostatistiques / bioinformatique.
L'équipe bioinformatique fournis des méthodes et des outils pour organiser, structurer et rendre disponible des données génomiques pour soutenir les activités de sélection végétale et les efforts d'identification de traits. L'équipe contribue également au développement et à la mise en place de nouveau processus de génération de données en laboratoire. Cette activité est essentielle pour notre processus de découverte de traits et en aval pour les activités d'édition de gènes et l'efficacité des programmes de sélection.

Missions

Vous contribuerez fortement à la définition et la mise en place de notre stratégie sur ces sujets et développerez une vision sur l'intégration efficace de sources multiples de données.

Vous serez responsable de la veille sur les nouveaux concepts et outils bioinformatiques qui pourraient améliorer notre efficacité et vous entretiendrez un réseau de partenaires externes.

Vous agirez comme un expert interne en bioinformatique appliquée pour soutenir l'identification de gènes d'intérêt en combinant efficacement des approches et des outils génétiques et génomiques.

Vous proposerez des solutions et des innovations pour améliorer l'efficacité de notre activité d'identification de traits pour la sélection.
Vous apporterez de l'expertise sur le traitement de données omics au-delà de la génération des données.
Vous contribuerez à la formation et au support des différentes équipes recherche sur votre expertise.
Vous jouerez un rôle clé dans la mise en place de nouveaux outils et méthodes, tout en s'assurant que les systèmes informatiques sont en place, et vous contribuerez au support utilisateur.

Vous participerez pleinement à l'émulation scientifique au sein du groupe Limagrain en général et de la branche grandes cultures en particulier.
Ce poste est rattaché au responsable de la plateforme biostatistiques et bioinformatique sur notre centre de recherche de Chappes rassemblant plusieurs équipes scientifiques et de sélection.

Profil

Vous êtes issu d'une formation de niveau doctorat en bioinformatique/ Biologie computationnelle/ génétique quantitative
Vous avez une expertise forte en bioinformatique appliquée à l'identification de traits.
Créatif et innovant vous avez su mettre en place des solutions et des outils en adéquation avec les besoins des équipes recherche.
Vous avez un réseau actif de contacts dans le milieu académique et privé.
Vous savez programmez efficacement, tout particulièrement le développement de workflows pour gérer, analyser, visualiser et générer des rapports sur des gros volumes de données.
Vous êtes capable de travailler et de manipuler des fichiers dans un environnement Linux ou Unix et de travailler avec des scripts shell. Vous êtes compétent en R, Python ou autre langage similaire pour l'analyse de données.
Une connaissance pratique des méthodes d'analyses statistiques et d'optimisation serait un plus.
Vous avez la capacité de gérer des projets de recherche de la conception à la conclusion, incluant l'organisation et la planification des opérations, interprétation des résultats de recherche.

Agile, vous savez travailler dans des environnements matriciels
Vous appréciez le travail en équipe et êtes bon communiquant à l'oral et à l'écrit

Vous maitrisez parfaitement l'anglais oral et écrit.

Localisation du poste

Localisation du poste

Europe, France, Auvergne, Puy de Dôme (63)

Lieu

Chappes

Critères candidat

Niveau d'études min. requis

Doctorat ou équivalent

Spécialisation

·  Agriculture / Agronomie
·  Informatique
·  Biologie/ Amélioration des Plantes

Niveau d'expérience min. souhaité

5 ans ou plus