MICROBIOLOGISTE (ALGUES TOXIQUES DES LACS ET RÉSERVOIRS EN MILIEU TR...
V.I.E. Abidjan (Abidjan) Master, Bac +5
Description de l'offre
AFFECTATION STRUCTURELLE
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
L'Institut de Recherche pour le Développement est un établissement public français à caractère scientifique et technologique
(EPST) qui intervient depuis plus de 60 ans dans les pays du Sud. Il est placé sous la double tutelle des ministères chargés de
la Recherche et des Affaires étrangères.
Ses activités de recherche, d'expertise, de valorisation et de formation ont pour objectif de contribuer au développement
économique, social et culturel des pays du Sud. Près de 40% des effectifs de l’Institut sont affectés à l’étranger et en Outremer.
Au sein de l’Unité Mixte de Recherche Unité mixte de recherche HSM et iEES
Le poste ouvert est mutualisée entre 2 Unités Mixtes de Recherche Unité, HydroSciences Montpellier (HSM) et l’Institut
d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES).
HSM, qui a depuis longtemps marqué son intérêt pour les régions méditerranéennes et tropicales, organise et développe
l‘essentiel de son activité scientifique autour de la ressource en eau. Trois thèmes clés sont ainsi privilégiés :
- l'eau dans l'environnement et les risques associés,
- l'eau ressource mobilisable et exploitable,
- l’eau et les changements globaux.
iEES Paris regroupe plus de 150 permanents et de nombreux personnels temporaires sur trois sites d'Ile de France, le principal étant localisée à l'UPMC. Ses objectifs sont (i) d'analyser et de modéliser l’organisation, le fonctionnement et l’évolution des
systèmes écologiques pour une écologie et des sciences de l’environnement prédictives, (ii) de contribuer à l’innovation en gestion durable de la biodiversité, des écosystèmes et des ressources biologiques et (iii) de former les étudiants aux avancées
récentes de l’écologie, des sciences de l’environnement et de l’ingénierie écologique. Au sein de cet Institut, l'Equipe Communautés Microbiennes des Ecosystèmes Continentaux s'intéresse plus spécifiquement à la diversité aux rôles des communautés microbiennes terrestres et aquatiques ainsi qu'à la survie des bactéries pathogènes des animaux et des plantes dans ces écosystèmes.
VIA 1 AN RENOUVELABLE
AFFECTATION GEOGRAPHIQUE
Institut Pasteur de Côte d’Ivoire, Abidjan
DESCRIPTION DU POSTE
Contexte Les travaux seront réalisés dans le cadre de deux projets de recherche qui portent sur la qualité de l’eau de la
lagune Aghien à Abidjan, sachant que cette lagune est utilisée comme ressource en eau douce par les
populations riveraines et qu’elle fait l’objet d’une évaluation approfondie pour une utilisation à plus grande
échelle pour alimenter une partie de la population d’Abidjan. Dans ce contexte général, un poste de Volontaire
International est ouvert pour un an, éventuellement renouvelable, afin de mettre en oeuvre dans la lagune
Aghien et dans deux de ses tributaires (i) un suivi de la communauté bactérienne totale et (ii) des approches
ciblées sur les bactéries pathogènes pour L’Homme et sur leur résistance et/ou multirésistance aux
antibiotiques.
Mission Les missions du/de la VI seront de coordonner (i) le suivi de l’échantillonnage d’eau de la lagune et ses deux
tributaires et (ii) les analyses qui seront réalisées sur les échantillons d’eau. Par ailleurs le/la VI participera à
la formation et à l’encadrement d’une thèse qui travaillera avec lui/elle.
Activités Les activités principales du VI seront les suivantes :
- Planifier et organiser avec le consortium travaillant sur la lagune les missions de terrain pour les prélèvements
- Participer aux prélèvements sur le terrain
- Préparer les ADN pour les approches de séquençage à haut débit et analyser des résultats
- Réaliser des dénombrements bactériens sur différents types de milieux et sélection/isolement de bactéries d’intérêt
- Mettre en oeuvre des approches de PCRq sur différents marqueurs de résistance
- Former et participer à l’encadrement de la thésarde de l’Institut Pasteur avec laquelle travaillera le/la VI et
d’étudiants(es) en Master II.
- Analyser les résultats et participer à la rédaction de publication
Compétences utilisation tout ou partie des approches qui seront utilisées.
Une expérience de terrain et particulièrement en milieu tropical sera appréciée.
PROFIL RECHERCHE
Formation jeune thésard dans le domaine de la microbiologie médicale et/ou environnementale
Environnement Les travaux seront réalisés au sein de l’Institut Pasteur de Côte d’Ivoire qui possède tous les équipements et
structures nécessaires à la mise en oeuvre des approches proposées.
Un séjour d’un mois en France dans les deux laboratoires associés au projet (Paris et Montpellier) permettra de préparer le
projet.
Conditions d’éligibilité au VI : Date de naissance, l’adresse permanente et numéro de Civiweb doivent être
impérativement mentionnés sur le CV
- nationalité d’un pays de l’Union Européenne
- moins de 28 ans à l’inscription sur civiweb
- moins de 29 ans au démarrage du contrat
CONTACT
Envoyer votre dossier de candidature (CV et lettre de motivation) à et