Stage Master Recherche en Métabolomique H/F (Biologie, biophysique et biochimie)

Description de l'offre

Domaine : Biologie, biophysique et biochimie

Contrat : Stage

Description du poste :

Au sein du Laboratoire de Génomique et Biochimie du Métabolisme, vous serez en charge de mettre en évidence des fonctions d’enzymes orphelines par une approche métabolomique (LC/MS) chez la bactérie modèle du laboratoire, Acinetobacter baylyi ADP1 (ADP1).
Vous utiliserez le métabolome d’ADP1 comme une bibliothèque de substrats pour ses enzymes de fonction inconnue. Il s’agira d’extraire le métabolome de la souche sauvage d’ADP1 et ensuite d’y incuber chaque enzyme candidate purifiée. Pour chaque enzyme, l’analyse comparative (par LC/MS) du métabolome incubé en présence et en absence de l’enzyme permettra de suivre les variations des signaux (m/z) correspondant au substrat (diminution de l’intensité du signal) et au produit (apparition/augmentation de l’intensité du signal). La détection des changements dans le spectre de masse sera facilitée par l’utilisation du logiciel libre XCMS. La masse précise des ions détectés sera ensuite utilisée pour interroger des bases de données de métabolites (KEGG et Metlin) afin de leur proposer une identité. Cette identité sera finalement confirmée en comparant leur temps de rétention sur la colonne chromatographique, leur masse précise ainsi que leur profil de fragmentation (MSn) avec ceux de composés de référence. L’identification des substrats et des produits des réactions enzymatiques permettra in fine d’établir la fonction des protéines impliquées.



Vous souhaitez mettre en pratique vos apprentissages théoriques et recherchez un stage conventionné d'une durée de 6 mois, débutant en février/mars 2020. Vous appréciez le travail en laboratoire et avez de solides connaissances en biochimie, enzymologie et chimie analytique.
Vous faites preuve de rigueur, d'un bon sens de l'analyse, d'esprit d'équipe et d'autonomie.
Vous maitrisez les logiciels de bureautique (Word, Excel) et rédigez avec aisance.

Ville : Evry