Les offres de “CEA”

Il y a 34 joursCEA

Chercheur en bio informatique H/F

  • CDD
  • Évry-Courcouronnes (Essonne)
  • Conception / Génie civil / Génie industriel

Description de l'offre

Détail de l'offre

Informations générales

Entité de rattachement

Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat.

Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un socle de recherche fondamentale. Le CEA s'engage depuis plus de 75 ans au service de la souveraineté scientifique, technologique et industrielle de la France et de l'Europe pour un présent et un avenir mieux maîtrisés et plus sûrs.

Implanté au cœur des territoires équipés de très grandes infrastructures de recherche, le CEA dispose d'un large éventail de partenaires académiques et industriels en France, en Europe et à l'international.

Les 20 000 collaboratrices et collaborateurs du CEA partagent trois valeurs fondamentales :

• La conscience des responsabilités
• La coopération
• La curiosité

Référence

2024-32327

Description de la Direction

Au sein de la Direction de la Recherche Fondamentale, l'Institut de biologie François Jacob, développe des recherches fondamentales, translationnelles et technologiques en radiobiologie et radiotoxicologie ; santé humaine (affections neurodégénératives, infectieuses et immunohématologiques) et génomique médicale et environnementale.

Description de l'unité

L'institut JACOB regroupe plusieurs départements dont le Genoscope et le Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH) situés à Evry. Ces départements mènent des projets de recherche propres et produisent des données de séquençage à haut-débit pour des projets collaboratifs hautement compétitifs.
Le Genoscope mène des projets de génomique environnementale pour l'exploration de la biodiversité. Après avoir participé au Projet Génome Humain, c'est un acteur majeur de la génomique en France, notamment dans le développement de techniques de séquençage massif d'ADN et d'analyses bioinformatiques.
Vous intégrerez le Laboratoire d'Analyses Génomiques des Eucaryotes (LAGE), une équipe de 20 chercheurs, ingénieurs et étudiants spécialisés dans la structure, l'écologie et l'évolution des génomes et communautés environnementales d'eucaryotes et de leurs virus via des approches essentiellement informatiques. L'équipe dispose notamment d'une grande expertise en données omiques pour explorer les caractéristiques fonctionnelles des organismes, ainsi que leurs relations avec leur environnement et l'évolution dans le temps et l'espace des génomes, des fonctions, et des communautés. Le LAGE est membre du consortium Tara (https://fondationtaraocean.org/en/home).

Le Genoscope est implanté à Evry (91), 30 km au sud de Paris.

Description du poste

Domaine

Biologie, biophysique et biochimie

Contrat

CDD

Intitulé de l'offre

Chercheur en bio informatique H/F

Statut du poste

Cadre

Durée du contrat (en mois)

24

Description de l'offre

Contexte scientifique

L’émergence et l’évolution précoce des eucaryotes sont des questions biologiques difficiles, notamment au regard de la complexité de la cellule eucaryote. Plusieurs scénarios ont été proposé concernant l’eucaryogénèse, mais le rôle que les virus ont pu y jouer reste sous-étudié.

Dans ce projet, nous explorerons en profondeur la longue co-évolution entre eucaryotes et virus à ADN double brin en étudiant et connectant leurs arbres évolutifs respectifs via de grandes ressources de génomes de référence et environnementaux.

Projet

Ce contrat de 2 ans fait partie du projet VirEukaGen (https://anr.fr/Projet-ANR-23-CE02-0025), qui vise à déterminer qualitativement et quantitativement le rôle que les virus, en particulier les Nucleocytovirus et associés, ont pu jouer dans l’origine et l’évolution précoce des eucaryotes modernes.

Missions

Des analyses de phylogénomique et phylogénétique comparatives seront appliquées pour reconstruire les arbres des eucaryotes et des Nucleocytovirus. Les gènes homologues, identifiés par similarité de séquences, groupement de profils et prédictions de structures, seront étudiés en détail. Ces analyses se feront sur de grandes ressources de génomes de référence et environnementaux d’eucaryotes et de virus. Vous participerez à l’élargissement de ces ressources, notamment à partir de métagénomes océaniques récemment séquencés.

Le CEA est un acteur engagé dans l’accueil l’insertion et le maintien dans l’emploi des salariés en situation de handicap.

Merci d'envoyer votre CV et lettre de motivation par email à Morgan Gaïa : morgan.gaia@genoscope.cns.fr

Profil recherché

Profil du candidat

Vous avez une formation de doctorat en biologie (génomique, bio-informatique, ou évolution).

Des compétences en bio-informatique (phylogénomique, phylogénétique, études de grands jeux de données) sont attendus.

Vous avez de solides connaissances en évolution et génomique eucaryotes et/ou virales.

Une expérience en évolution profonde est un plus.

Faire de chaque avenir une réussite.
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